(из комментов)
Со структурой форумов есть одна проблема: может быть только один раздел по одной теме. Но качество раздела очень зависит от правил, модератора и "костяка" первых пользователей. Если получилось неудачно, альтернативу уже не создашь. Или если образовался какой-то идеологический перекос.
С другой стороны, если структура нужна для удобства навигации, её можно предоставить. Только дать возможность пользователю менять её под себя.
Вообще, возможностей много. Могут быть большие группы ("супергруппы") с подразделами. Могут быть группы в стиле Fido: где группа никому не принадлежит, а является публичной площадкой, а модератора можно переизбрать. Мне кажется, что всё это надо выстраивать постепенно, по ходу того, как будет расти число пользователей.